Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPREP23469 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms