Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms