Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms