Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD58P19256 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD58P19256 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms