Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms