Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPD1P17405 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms