Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNAP12004 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNAP12004 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCNAP12004 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNAP12004 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms