Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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