Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms