Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCATO75600 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCATO75600 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms