Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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