Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BQ06 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BQ06 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BQ06 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BQ06 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BQ06 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BQ06 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BQ06 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BQ06 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BQ06 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BQ06 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3BQ06 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms