Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms