Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 336.3 ms