Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms