Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms