Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3AQ9Y6K1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms