Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA3Q9Y6H8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms