Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms