Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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