Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D2

MSRB2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2Q9Y3D2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSRB2Q9Y3D2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSRB2Q9Y3D2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRB2Q9Y3D2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRB2Q9Y3D2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms