Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRKBQ9Y3C4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms