Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3B6Q9Y3B4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B6Q9Y3B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B6Q9Y3B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms