Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFR3BQ9Y2G0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms