Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF13BQ9Y275 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms