Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC5Q9UQL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC5Q9UQL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms