Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN6Q9UQ52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN6Q9UQ52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms