Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPK3Q9UPE1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPK3Q9UPE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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