Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNRGQ9UMZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNRGQ9UMZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms