Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN11Q9UMQ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN11Q9UMQ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms