Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4EQ9ULY5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4EQ9ULY5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms