Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD2Q9UKL4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJD2Q9UKL4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms