Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD1Q9UIS9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MBD1Q9UIS9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms