Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHPKQ9UHJ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHPKQ9UHJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms