Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO40Q9UH90 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO40Q9UH90 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO40Q9UH90 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms