Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRRDQ9UH36 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRDQ9UH36 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms