Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
TUBGCP4Q9UGJ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP4Q9UGJ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms