Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA6Q9UF33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms