Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEF1Q9UBV8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms