Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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