Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP28Q9P2N2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms