Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTGFRNQ9P2B2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms