Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXXC1Q9P0U4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXXC1Q9P0U4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms