Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFA13Q9P0J0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA13Q9P0J0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA13Q9P0J0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms