Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRF1Q9NZS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLRF1Q9NZS2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLRF1Q9NZS2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms