Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTMR4Q9NYA4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR4Q9NYA4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms