Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX43Q9NXZ2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms