Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3EQ9NVU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms