Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX18Q9NVP1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms