Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL1Q9NSC2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms